طبقهبندی مارمولکها به معنای دستهبندی علمی این جانوران خزنده در سلسله مراتب زیستشناسی است. مارمولکها در زیرردهای از خزندگان قرار دارند و براساس ویژگیهای آناتومیکی، زیستی و ژنتیکی به خانوادهها، جنسها و گونههای مختلف تقسیم بندی میشوند. این طبقهبندی به درک تنوع و ارتباط بین گونهها کمک میکند.