تصفیه ثالثیه یا پیشرفته فرآیندی است که پس از مراحل اولیه و ثانویه تصفیه فاضلاب انجام میشود تا آلودگیهای باقیمانده شامل مواد شیمیایی، میکروبی، و مادههای معلق به حداقل ممکن برسد. این مرحله معمولاً شامل فرآیندهای فیلتراسیون، جذب، یا استفاده از مواد شیمیایی جهت از بین بردن مواد مضر و بهبود کیفیت آب است.