دانشنامه اسلامی
خوئینی به حاج ملاآقا نیز مشهور بوده است. پدرش ملامصطفی (متوفی حـ ۱۲۷۵) و جدش ملااحمد (متوفی ۱۲۴۵) هر دو عالمانی برجسته و صاحب آثاری در فقه بودند. خوئینی در ۱۲۴۷، خوئین به دنیا آمد.
او در هشت سالگی، در زادگاهش یادگیری علوم مقدماتی چون صرف و نحو را آغاز کرد. و پس از پنج سال، برای ادامه تحصیل به قزوین رفت و سطوح متوسطۀ علوم دینی را از استادانی چون ابوطالب بهشتی قزوینی، سید رضی قزوینی و عبدالکریم ایروانی فراگرفت.
