کنز الدقائق و بحر الغرائب اثری گرانسنگ از میرزا محمد مشهدی، فرزند محمد رضا قمی، از برجستگان علم حدیث و تفسیر امامیه در قرن دوازدهم هجری قمری است. این تفسیر سترگ در چهار مجلد بزرگ به رشته تحریر درآمده و بیانگر تبحر و تخصص عمیق مؤلف در علوم قرآنی است. میرزا محمد مشهدی، با وجود تألیفاتی در حوزههای اخلاق، فقه، تاریخ، فضائل ائمه اطهار (علیهم السلام)، ادبیات عرب، پاسخ به شبهات شیعه، شرح صحیفه سجادیه و زیارت رجبیه، و علم کلام، تفسیر را اوج علوم دینی و بنیان تمام قواعد شرع مقدس میدانست. وی برای دستیابی به تفسیری منطقی و معتبر، بر لزوم تسلط بر سایر علوم دینی و فنون ادبی تأکید فراوان داشت و در این راه از هیچ کوششی فروگذار نکرد. پیش از نگارش این تفسیر سترگ، او با اتکا به تخصص و باور عمیق خود به علم تفسیر، تعلیقاتی بر تفسیر «کشاف» زمخشری و حاشیهای بر تفسیر بیضاوی شیخ بهائی نگاشت. همچنین، اثری قرآنی دیگر از او با عنوان تبیان سلیمانی، تفسیری روایی به زبان فارسی است که دو جزء از آن در کتابخانه آستان قدس رضوی موجود میباشد.
نسخههای متعددی از تفسیر کنز الدقائق و بحر الغرائب در کتابخانههای معتبر سراسر جهان از جمله کتابخانه شیخ عبد الحسین تهرانی (منتقل شده به کربلا)، کتابخانه شیخ محمد صالح برعانی در کربلا (شامل دو مجلد به خط مؤلف)، کتابخانه آستان قدس رضوی (سه مجلد)، کتابخانه مدرسه سپهسالار (شهید مطهری ره) (دو مجلد)، کتابخانه آیت الله مرعشی در قم (چند نسخه)، کتابخانه مرکزی دانشگاه تهران، و کتابخانه مجلس شورای اسلامی (نسخهای شامل ربع اول و دوم با تقریظ علامه مجلسی و محقق خوانساری) موجود است. همچنین، نسخه استاد شانه چی که به کتابخانه آستان قدس رضوی منتقل شده، بر غنای نسخهشناسی این اثر افزوده است. این گستردگی نسخ خطی، گواه اهمیت و جایگاه والای این تفسیر در میان آثار تفسیری شیعه است و نشان از اهتمام علما و علاقهمندان به این اثر در طول تاریخ دارد.