توالی تجزیه ای

{degradative succession} [مهندسی منابع طبیعی- محیط زیست و جنگل] نوعی توالی که بر روی اندامگان های مرده و در مدت نسبتاً کوتاهی به وجود می آید

💡 این خط برخی از امکانات مدیریت توالی را نشان می‌دهد. یک دنباله ممکن است شامل مجموعه ای از هر نوع باشد، و این را می‌توان قطعه قطعه کرد (برای گرفتن زیرمجموعه ای از داده‌ها در یک توالی) و در عبارات بدون نیاز به توابع خاص به هم پیوست.

💡 تناوب‌هایِ کوتاهِ پالیندرومِ فاصله‌دارِ منظمِ خوشه‌ای (به انگلیسی: Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) یا به اختصار کریسپر (به انگلیسی: CRISPR) بخشی از دی‌ان‌ایِ پروکاریوت هستند که حاوی تناوب‌های کوتاهِ توالی‌های بنیادین هستند.

💡 قوانین توالی به صورت جفت رشته‌ها هستند. معمولاً به شکل الگوی → نشان داده می‌شوند. هر قاعده ممکن است عادی یا نهایی باشد.

💡 معمولاً معیار خاصی برای تعیین کردن مقادیر ε و σ وجود ندارد و این مقادیر با توجه به هدف ما از هم‌ترازسازی توالی‌ها تفاوت می‌کنند. معمولاً هنگامی که به دنبال دنباله‌های نزدیک به هم هستیم، مقدار جریمهٔ ایجاد شکاف (σ)، نسبتاً بزرگتر از زمانی است که دنبال رشته‌های متفاوت از هم می‌باشیم.

💡 توالی اصلی با استفاده از جواب‌های به دست آمده و به وسیلهٔ نرم‌افزارهای بازسازی توالی ساخته می‌شود. ابتدا جواب‌هایی که هم‌پوشانی دارند به هم متصل می‌شوند و سپس با بررسی ارتباط آن‌ها رشتهٔ اصلی را به دست می‌آورند.

💡 این الگوریتم نمونه‌ای از برنامه‌ریزی پویا است و اولین کاربرد برنامه‌ریزی پویا در مقایسهٔ توالی‌های زیستی است.