کتاب تفسیری «جواهر التفسیر» که به زبان فارسی نگاشته شده است، در حال حاضر تنها یک جلد از آن به زیور طبع آراسته گشته که شامل مقدمات تفسیری و تفسیر کامل سوره حمد است. این اثر ارزشمند در صورت تکمیل نهایی، به سه جلد خواهد رسید و تمامی محتوای آن تفسیر سورههای حمد، بقره، آل عمران و بخش آغازین سوره نساء (تا آیه 84) را در بر خواهد گرفت. طبق اظهارات محققان، مواد و منابع مورد نیاز برای تألیف دو جلد بعدی گردآوری شده است؛ با این حال، به دلیل نبود فرصت مناسب، فرایند تألیف و پاکنویسی آنها به تعویق افتاده است. از نظر توزیع حجمی، یکسوم کل اثر به تفسیر سوره حمد اختصاص یافته و دو سوم باقیمانده بین سوره بقره، آل عمران و قسمت مذکور از سوره نساء تقسیم شده است.
شایان ذکر است که نویسنده، کاشفی، تمام تواناییها و مهارتهای تفسیرنویسی خود را در مقدمه و تفسیر سوره حمد به کار بسته است؛ به گونهای که این بخش به عنوان اوج ظرافتهای ادبی و تفسیری اثر شناخته میشود. اما از ابتدای سوره بقره، رویه نگارش تغییر کرده و طریق ایجاز (اختصار) در پیش گرفته شده و آرایههای ادبی نیز به نسبت کاهش یافتهاند. این تفاوت مشاهدهشده در همین مقدار موجود، نشاندهنده دو سبک متمایز در نگارش تفسیری و شیوه ادبی در اثر کاشفی است. در باب زمانبندی نگارش، پایان تفسیر سوره حمد در نسخهای که در مدرسه عالی شهید مطهری موجود است، ماه رجب سال 888 هجری قمری ذکر شده است، هرچند خود کاشفی در یک بیت شعر، تاریخ اتمام را سال 890 هجری قید کرده است.
تاریخ آغاز نگارش این تفسیر به سالهای 886 یا 887 هجری قمری بازمیگردد. «جواهر التفسیر» محصول دوران بلوغ فکری و پختگی علمی کاشفی محسوب میشود، بهطوری که تخمین زده میشود سن ایشان در زمان تألیف آن حدود پنجاه سال بوده باشد. لازم به توضیح است که عنوان مختصر «الجواهر» در برخی منابع تفسیری به اشتباه به عنوان یکی از کتابهای کاشفی ذکر شده است، در حالی که چنین اثری هرگز وجود خارجی نداشته و این عنوان صرفاً یک خطای منبعشناسی است.