عالم فقیه و مجاهد بزرگ، سید هادی حسینی بجستانی خراسانی، در روز جمعه، اول ذیالحجه سال ۱۲۹۷ هجری قمری، در کربلای معلی دیده به جهان گشود. ایشان فرزند ارشد عالم شهیر خراسان، سید میرعلی حسینی هروی بجستانی خراسانی، بود که در حدود سال ۱۲۵۲ هجری قمری در بجستان دیده به جهان گشود. پدر ایشان، مراحل مقدماتی علوم دینی را در حوزهی علمیهی مشهد مقدس سپری کرد و سپس در سال ۱۲۶۱ هجری قمری عزم نجف اشرف نمود. سید میرعلی بیش از سی سال، یعنی تا سال ۱۲۹۱ هجری قمری، در آن شهر شریف به تحصیل علوم دینی اشتغال داشت و از محضر اساتید بزرگی بهره برد.
سید میرعلی حسینی هروی بجستانی خراسانی در طول اقامت خود در نجف اشرف، دروس سطوح عالی و خارج فقه و اصول را نزد فقها و مراجع بزرگ عصر خویش، از جمله شیخ مرتضی انصاری و میرزای شیرازی (صاحب فتوای تنباکو)، فرا گرفت و موفق به کسب درجۀ رفیع اجتهاد گردید. پس از تکمیل تحصیلات، ایشان مدتی در سامرا مقیم شد و سپس بنا به فرمان و مأموریت مستقیم میرزای شیرازی، به شهر همدان اعزام شد تا به ایفای نقش در حل و فصل اختلافات مذهبی میان پیروان مکتب شیخیه و اصولیون بپردازد.
پس از اتمام مأموریت در همدان، سید میرعلی مدتی نیز در کرمانشاه به تبلیغ و ترویج معارف دینی مشغول بود و سرانجام در سال ۱۳۰۹ هجری قمری به خراسان بازگشت. از این رو، سید هادی حسینی بجستانی خراسانی که خود در کربلا متولد شده بود، میراثدار علمی و اخلاقی پدری بود که سی سال در عتبات عالیات تحصیل کرده بود. ایشان (سید میرعلی) در سن ۸۵ سالگی و در تاریخ ۱۳ شوال سال ۱۳۳۷ هجری قمری دار فانی را وداع گفت و در بقعهای ملحق به مسجد گوهرشاد در مشهد مقدس به خاک سپرده شد.