برای نمونه کامپایلر بسکام با زبان بیسیک برای برنامهنویسی این نوع از ریزکنترلگرها میتواند به کار رود. همچنین نرمافزار CodeVision، برای برنامهنویسی به زبان C (سازگار با این ریزکنترلگرها) بسیار رایج است (البته این برنامه بیشتر میان کاربران ایرانی رواج دارد، در میان کاربرهای خارجی کمتر دیده شده و بیشتر از برنامهٔ رسمی شرکت Atmel استفاده میشود).
کامپایلرهایی به زبان بیسیک و C که زبانهایی پرکاربردی در دنیا محسوب میشوند، برای این نوع ریزکنترلگرها طراحی شدهاست. البته در حال حاضر استفاده از کامپایلر بسکام BAScom که نسبت به زبان c بسیار راحتتر و سریع تر عمل میکند جایگزین زبان c شدهاست. همچنین زبان اسمبلی را نیز میتوان برای برنامهنویسی به کار برد.