دانشنامه اسلامی
از وی آثار بسیاری بر جای مانده است که مهمترین آنها کتاب 1-غرائب القرآن و رغائب الفرقان است.دیگر تألیفات وی عبارتند از:2-اوقاف القرآن 3-البصائر فی مختصر تنقیح المناظر 4-تفسیر التحریر که شرح تحریر مجسطی خواجه نصیر طوسی است.5-لب التأویل در تفسیر قرآن 6-توضیح التذکرة که شرح تذکرۀ خواجه نصیر طوسی در علم هیئت بوده است.7- رساله ای در حساب و به زعم بعضی «خلاصة الحساب»شیخ بهایی از همین رساله اخذ شده است 8-شرح شافیۀ ابن حاجب در علم صرف معروف به شرح نظام.9-ترجمۀ فارسی قرآن البته در بعضی نسخ تفسیر، عبارتی از مفسر نقل گردیده که اتمام آن را اوائل صفر سال 730 هجری در دولت آباد هند، نشان می دهد.
تفسیر غرائب القرآن و رغائب الفرقان