دانشنامه اسلامی
مرحوم علامۀ مجلسی «ره» در تقریظ خود بر تفسیر کنز الدقائق می نویسد: «لله در المولی الفاضل، الکامل المحقق المدقق البدل النحریر، کشاف دقائق المعانی بفکره الثاقب و نقاد جواهر الحقایق برأیه الصائب، اعنی الجنیر الارشد میرزا محمد مؤلف هذا التفسیر» مرحوم آغا جمال الدین خوانساری «قدس سره» نیز تقریظی جامع بر تفسیر کنز الدقائق نگاشته و در آن بر مراتب فضل، علم،دقت و تلاش میرزا محمد و اعتبار، اهمیت و جایگاه علمی تفسیر مذکور، تأکید فراوان داشته است.
صاحب روضات الجنات جلد 7 صفحۀ 110-111، میرزا محمد را نویسنده ای دانشمند، با تقوا، ادیب، محدّث فقیه و مفسری آگاه شمرده است.
صاحب ریحانة الادب:جلد 5 صفحۀ 320 می نویسد:عالمی است عامل،جامع، ادیب،فاضل بارع،فقیه، مفسر، محدّث موثق، از اعاظم علمای عهد مجلسی،محقق سبزواری و فیض کاشانی است.
میرزا محمد مشهدی اگر چه در زمینه های اخلاق،فقه، تاریخ و فضائل ائمه «علیهم السلام»، ادبیات عرب، پاسخ اشکالات بر شیعه،شرح صحیفه سجادیه و زیارت رجبیة و کلام،صاحب تألیفاتی است، لیکن تبحّر و تخصّص اصلیش در علم تفسیر بوده است، وی علم تفسیر را رأس همۀ علوم دینی و سنگ بنای همۀ قواعد شرع مقدس دانسته، و در راه وصول به آن از هیچ کوششی دریغ نورزیده است، او معتقد بود،دستیابی منطقی و قابل اعتماد به علم تفسیر،قبل از هر چیز، منوط به تفوّق در علوم دینی و انواع صنایع ادبی است.
میرزا محمد مشهدی،قبل از آنکه به تألیف تفسیر شریف «کنز الدقائق و بحر الغرائب» بپردازد، به حسب همان تخصص، علامة و اعتقادی که به علم تفسیر داشته، تعلیقاتی بر تفسیر کشّاف زمخشری و حاشیۀ شیخ بهائی بر تفسیر بیضاوی، نگاشته است.
