دانشنامه اسلامی
سید علی نخست از پدرش مرحوم آیت الله سید محمدرضا شفیعی، قرائت قرآن و مسائل شرعی آموخت، پس از آن وارد مدارس جدید گردید و تا پایان ششم ابتدایی را در آن مدارس گذراند. او سپس، وارد تحصیلات علوم اسلامی شد و «جامع المقدمات» و «مغنی» را نیز نزد پدرش فراگرفت و به تجزیه و ترکیب و مطالعه روایات و اشعار عرب، تشویق شد. همچنین مرحوم آیت الله سید علی بهبهانی رامهرمزی (متوفای سال 1395ق) بر او بسیار تأثیر گذاشت. ایشان همچنین از حجج اسلام و اساتید ذیل، دروس آتی را آموخت: سید محمدحسین فقیه (نحو و احکام)؛ شیخ ابوالقاسم انصاری (سیوطی، حاشیه و بخشی از مطول )؛ سید اسماعیل مرعشی (معالم ، شرح لمعه و مختصر المعانی)؛ سید محمدکاظم آل طیب (قوانین الأصول).
او به سبب فقدان شرایط کافی و مناسب برای تحصیل، در عصر مرحوم آیت الله بروجردی عازم قم شد، اما به شکست انجامید؛ ازاین رو، تصمیم گرفت به عراق هجرت کند. سرانجام با تحمل مشکلات فراوان و ده روز سرگردانی در خرمشهر و آبادان بالاخره سال 1339ش، وارد نجف اشرف شد و در مدرسه بزرگ آیت الله بروجردی حجره تهیه کرد. در مدت حدود سه سال، از اساتید و حضرات آیات ذیل، این دروس را آموخت:
1. شیخ محمد علمی اردبیلی - از رجال حادثه مسجد گوهرشاد - (بحث قطع از کتاب رسائل)؛
2. میرزا کاظم تبریزی (جلد اول کفایة الأصول)؛
