فراژنگان شناسی به مطالعه ژنوم یک جامعه میکربی اشاره دارد که بدون نیاز به جداسازی و کشت اجزای آن انجام می‌شود. این علم به محققان این امکان را می‌دهد که تنوع ژنتیکی و عملکردهای بیولوژیکی میکروارگانیسم‌ها را در محیط‌های مختلف بررسی کنند، بدون اینکه نیاز به جداسازی و کشت آنها در آزمایشگاه باشد.
فراژنگان شناسی از تکنیک‌های پیشرفته توالی‌یابی DNA استفاده می‌کند که به محققان این امکان را می‌دهد تا اطلاعات ژنتیکی را به طور همزمان از هزاران یا میلیون‌ها میکروارگانیسم استخراج کنند. این روش به ویژه در مطالعه میکروبیوم‌ها (مجموعه میکروارگانیسم‌ها در یک محیط خاص) و تنوع میکروبی در محیط‌های مختلف مانند خاک، آب، و روده انسان کاربرد دارد.
