فرهنگ قرآن جلد دوم شامل واژهها و مفاهیم متنوعی است که به ترتیب الفبایی تنظیم شدهاند. در این جلد، موضوعاتی مانند «ابابیل» و ماجرای «اصحاب فیل» بررسی شده و نقش آنها در تاریخ و قرآن مورد توجه قرار گرفته است. همچنین ابابیل در زمینههای مختلف همچون قدرت الهی و ماموریتهای خاص مورد بحث قرار گرفتهاند. اصطلاح «ابتر» نیز در قرآن آمده و به معنای بیبهره یا قطع شدن نسل دشمن پیامبر توضیح داده شده است. افزون بر این، ابتکار در حوزههای مختلف مانند آجرپزی، معماری، ذخیرهسازی غلات و مجسمهسازی مورد بررسی قرار گرفته و نمونههایی از نوآوریها در تاریخ بشر ارائه شده است.
موضوع «ابر» نیز در این جلد به تفصیل مطرح شده است؛ از جمله ابر سایهافکن، ابر عذاب، نقش ابر و باد در طبیعت، ابرهای بارانزا و بیباران، ابرهای یخی و همچنین منشاء باروری ابرها. علاوه بر آن، مفاهیم مرتبط با ابرای دین و ابرای دیه و ابرای مهریه در قرآن و احادیث مورد اشاره قرار گرفتهاند. اصطلاح «ابرار» نیز در این جلد بررسی شده و اوصاف، پاداش، سرنوشت، مصادیق و مقام ابرار بهطور جامع بیان شده است تا نقش آنها در آموزههای اخلاقی و دینی روشن شود.
یکی از شخصیتهای مهم که در این جلد به تفصیل مورد بحث قرار گرفته، «ابراهیم» است. ابراهیم در قرآن در موقعیتهای مختلف از جمله آرامش در زندگی، قرار گرفتن در آتش، زندگی پس از مرگ، حضور در بهشت و محضر خداوند مورد بررسی قرار گرفته است. روابط خانوادگی و خویشاوندی او با آزر، ارتباطش با اسحاق و اسماعیل، و امور خارقالعاده و مبارزه با بتپرستی نیز تشریح شدهاند. علاوه بر این، ابراهیم و تلاشهای او در آبادانی، ارتباط با اجرام آسمانی و احیای مردگان از دیگر موضوعات مهم این جلد است که نمایانگر جایگاه ویژه او در قرآن و تاریخ دین است.
